О смягчающих обстоятельствах лучше всего заявить либо в возражениях на Акт налогового органа, либо направить в налоговую ходатайство о применении обстоятельств, смягчающих ответственность. Единая форма ходатайства не установлена. Можете составить его по своему усмотрению.
Пример ходатайства можно скачать здесь.Если обстоятельства, смягчающие ответственность, можно подтвердить документами - приложите их к ходатайству.